當代藥理學科學研究，黃連有退熱、抗感染、抑菌、抗心率失常、降血壓、正性肌張力功效，有益膽、抑止胃液代謝、抗拉肚子等功效，有抗急性炎癥、防癌、抑止機構新陳代謝及抗潰爛等功效。
黃連
黃連選方
1. 口腔黏膜潰瘍
黃連、地榆各10g，樟腦末0.5～1.Og。黃連、地榆倒成粗末，放水150ml，煎至50ml，添加樟腦末，密封瓶搖勻儲備用。用消毒殺菌棉球將藥水施膠在膿點上，早中晚餐前、餐后各1次，抹藥后不漱口清潔，3～5日服藥1劑。共醫治536例病人，在其中反復性牙齦腫痛283例，外傷性119例，泡疹性124例。以服藥后3日內，部分腫脹、痛疼消散、消退，潰爛痊愈視作治愈。反復性牙齦腫痛治愈108例，合理162例;外傷性各自為87例、32例;泡疹性口炎各自為72例、43例。

2.中耳炎
(1)黃連15g，樟腦1g，75%乙醇100ml，做成醇浸滴耳液。先將3%雙氧水(雙氧水)水溶液清洗耳道，拭凈，將滴耳劑滴進患耳，每一次2滴，每天2次，至治愈。共醫治53例病人，治療率達92.5%，一般7日治愈。
(2)3%雙氧水(雙氧水)水溶液消除濃液后，取小檗堿(黃連素)滴耳液，每一次1～2滴，每天3次滴耳，并且做好對癥治療解決。吳本端共醫治82例病人，痊愈52例，轉好27例，失效3例。
3.單泡疹病毒性角膜炎
藏紅花、黃連各2g，用200ml純凈水侵泡24鐘頭，經水煎、過慮、殺菌，調pH值至7.4做成滴眼液，每天6～8次點眼。停止使用別的各種各樣藥品。共醫治48例病人51眼，淺部型40例病人43眼，深層次型8例病人8眼。以角膜潰瘍痊愈，熒光素染色劑呈陰性，眼角膜浮腫和后彈性層褶皺消散，眼角膜后沉著冷靜物消退或殘余非常少，房閃呈陰性視作痊愈。結果痊愈和好轉率達94%， 治愈者均值痊愈時間為15日。除1例1眼深層次型外，其他病案服藥后眼睛視力大多數有大大提高。
4.淺表性胃炎
黃連500g，食用醋500ml，白砂糖500g，山楂干1000g。加沸水4000ml，混和侵泡(禁止使用塑膠制品器皿)7日就可以。每一次50ml，每天3次，餐后服，并用90～150日。自1979年年末共醫治24例病人，均經做胃鏡、胃酸解析診斷。結果胃鏡檢查復診除2例由淺表性胃炎變化為淺表性胃炎外，其他病案胃粘膜委縮性變病消退，恢復過來;臨證主要表現型體漸豐，胃疼、胃漲消退，胃口提升或一切正常;胃酸解析空肚總酸值、礦酸酸值達一切正常范疇;隨診至1985年無1例病變或發作。
5.反復性迅速型心率失常
黃連10g，炙甘草10g。每天1劑，煎汁后少量多次頻服。7日為1個治療過程，隔1星期過后再開展第二個治療過程。共醫治42例病人，均清除心血管器質性。以病癥徹底消退或基礎消退，心電圖檢查恢復過來視作效果顯著。均值醫治3.8個治療過程，并隨診1年左右，陣發心跳過速36例，效果顯著19例，改進12例，失效5例;高發房性期前收縮4例，效果顯著2例，改進、失效各1例;高發室性期前收縮2例，效果顯著、失效各1例。

6.原發性高血壓
觀查病案停止使用各種各樣降壓藥物，1星期過后給與內服小檗堿(黃連素)片每一次0.4～0.5g，每天3次，治療過程4周。共醫治42例病人，醫治前血壓值取非同一天3次精確測量平均值。Ⅰ期13例病人，效果顯著8例，合理5例;Ⅱ期19例病人，效果顯著10例，合理6 例，失效3例;Ⅲ期10例病人，合理2例，失效8例。病人服小檗堿(黃連素)片后3～5日心率剛開始降低，1星期過后達最低值;收宿壓均值降低42mmHg。
7.帶狀瘡疹
黃連、梔子各9g，黃芩、黃柏、生甘草各6g，柴胡、白蒺藜、沙參各10g，蓮翹15g。每天1劑，水泡服。蔣薇等以黃連祛毒湯加味共治療帶狀皰疹67例，服藥7～12日，獲愈62例，轉好5例。
8.腦卒中康復后焦慮抑郁癥
黃連、柏子仁、酸棗仁各15g，黃芩、赤芍各12g，阿膠糕、龜版各15g，生地黃20g，主龍骨、杜蠣各30g，雞子黃2枚。每天1劑，水煎溫服，醫治4周為1個治療過程。黃堅紅等將中醫學辯證為陰虛內熱、心腎不交型腦卒中康復后焦慮癥患者以黃連阿膠糕湯加味醫治36例，總高效率達88.89%。
9.反流性食道炎
法半夏、薏苡仁、浙貝母、海螵蛸各15g，炙甘草、竹茹、枳殼、黃連各10g，茯苓6g。每天1劑，水泡服。林益群以黃連溫膽湯加味共醫治反流性食道炎32例，總高效率達90.62%，復發為20.69%。
10.白喉
(1)黃連粉每一次0.6g，每天4～6次，內服，并相互配合1%黃連水溶液漱口清潔。醫治輕疾白喉11例，人體體溫在1～3日恢復過來，假膜均值在2.6日消散。醫治后咽拭子塑造均值在2.8日變為呈陰性。
(2)10%黃連梗浸液(黃連梗10g放水侵泡48鐘頭濾過，煎出100ml，涼透預留)以噴霧機噴到口腔科內，每天3～4次。共醫治50例病人，所有獲愈。
11.傷寒論
黃連粉適當，裝進空心膠囊內，每一次內服2g，每4鐘頭1次，直到人體體溫修復3～5日才行。共醫治15例病人，痊愈 13例，失效2例。痊愈病人徹底降燒的均值天數為5.6日。
12.結核病
小檗堿(黃連素)片每一次300mg，每天3次，內服，3月為1個治療過程。共醫治30例病人，經醫治后，病人的咳血、發燙、干咳等病癥所有消退，排菌者的陰轉率達83.3%，X線線片疾病消化吸收轉好。
13.猩紅熱
內服黃連干浸膏(每0.25g約等于原生態藥1g)， 少年兒童使用量為0.15～0.3g，成人0.45g，每天3～4次，持續服藥6日，極少數病人兼有5%黃連液體鼻或噴喉。共醫治38例病人，均獲治愈;也許多人用10%黃連糖漿內服醫治44例病人，所有獲愈。
14.肺膿腫
選用支氣管內滴進與內服另外開展。每一次支氣管滴進小檗堿(黃連素)4～6mg，每天1次;另外每天取小檗堿(黃連素)1.2～4.8g，分3次內服，4周為1個治療過程，每過1周復化驗血常規、痰基本及X線拍胸片1次。共醫治32例病人，在其中變病在1個肺泡內28例，治愈14例，效果顯著10例，發展3例，失效1例;超出1個肺泡4例，效果顯著和發展各1例，失效2例;X線肺部ct診斷有裂縫25例，醫治后合閉23例，失效2例。
15.膿胸
川黃連適當，研細末，用浸水煎2次，配置成10%的水溶液做電離子透入，每一次20分鐘，每天1次，15～20次為1個治療過程。如變病頑固者，歇息10今后再次下1個治療過程。共醫治12例病人，透入10次之內獲愈3例，轉好1例;透入10～23次獲愈6例;另2例病情惡化，操縱感柒失效，僅做多次透入治療法即出現呼吸衰竭而身亡。

16.潰瘍性直腸炎
(1)粉末噴涂法:先清洗病人腸內容物，凡應用乙狀結腸鏡可窺探到的潰爛以及他發炎變病，均能用含有長金屬軟管的噴粉器,將黃連粉立即噴入潰爛或變病位置，每一次服藥1.8～2.4g，隔天1次，9次為1個治療過程，之后視病況必須可每過1周開展1個治療過程。
(2)精準定位灌腸法:變病如系低位，按X線查驗測知的變病位置，測算好自肛門口到變病區域間距插進橡膠軟管(應用洗胃管、強度適合)，待橡膠軟管頭頂部到達病變處，將生黃連粉滲入150ml溫開水中灌進。掛藥后依據變病位置選用左邊、右邊平躺和屁股低位等姿勢，另外囑病人用兩手被壓迫腸段變病的兩邊清靜歇息，一般1～2 鐘頭可隨便主題活動。隔天清潔灌腸1次，9次為1個治療過程。必須時每過1周可開展第2～3個治療過程。
行粉末噴涂法和灌腸法醫治，剛開始時偶有疼痛感，經2～3次醫治后疼痛感就可以消退，而且無別的負作用。如加上適當普魯卡因顆粒劑(皮膚過敏實驗呈陰性者)，